Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP43Q70EL4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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