Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms