Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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