Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF2Q5BJF6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms