Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTLL9Q3SXZ7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms