Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RRN3P1Q2M238 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms