Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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RPE65Q16518 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
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RPE65Q16518 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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RPE65Q16518 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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RPE65Q16518 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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RPE65Q16518 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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RPE65Q16518 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RPE65Q16518 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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