Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTRK3Q16288 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms