Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms