Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
R3HDM1Q15032 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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