Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TRIM25Q14258 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TRIM25Q14258 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TRIM25Q14258 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
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TRIM25Q14258 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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TRIM25Q14258 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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TRIM25Q14258 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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TRIM25Q14258 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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TRIM25Q14258 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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