Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUL1Q13616 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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CUL1Q13616 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CUL1Q13616 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CUL1Q13616 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CUL1Q13616 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CUL1Q13616 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CUL1Q13616 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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