Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTMR3Q13615 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms