Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC1Q13547 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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