Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCIRG1Q13488 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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TCIRG1Q13488 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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TCIRG1Q13488 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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