Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMD2Q13200 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms