Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms