Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANK3Q12955 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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