Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FOXF2Q12947 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FOXF2Q12947 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FOXF2Q12947 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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