Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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