Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ID3Q02535 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ID3Q02535 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms