Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms