Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms