Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COG7P83436 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COG7P83436 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COG7P83436 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms