Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRX1P78414 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms