Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHB3P54753 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHB3P54753 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHB3P54753 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHB3P54753 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHB3P54753 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHB3P54753 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHB3P54753 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms