Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA2P51531 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA2P51531 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms