Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms