Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCLCP48506 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCLCP48506 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLCP48506 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLCP48506 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms