Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANGAP1P46060 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms