Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms