Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms