Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSX1P28360 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSX1P28360 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSX1P28360 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSX1P28360 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSX1P28360 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSX1P28360 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSX1P28360 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSX1P28360 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSX1P28360 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSX1P28360 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSX1P28360 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSX1P28360 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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