Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms