Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL9A1P20849 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL9A1P20849 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COL9A1P20849 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL9A1P20849 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COL9A1P20849 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL9A1P20849 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL9A1P20849 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL9A1P20849 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL9A1P20849 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL9A1P20849 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL9A1P20849 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms