Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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