Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms