Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARP2O94887 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARP2O94887 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARP2O94887 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARP2O94887 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARP2O94887 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARP2O94887 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARP2O94887 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARP2O94887 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FARP2O94887 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FARP2O94887 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FARP2O94887 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FARP2O94887 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms