Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms