Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms