Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF1O43189 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF1O43189 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF1O43189 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF1O43189 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF1O43189 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PHF1O43189 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHF1O43189 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHF1O43189 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHF1O43189 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHF1O43189 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHF1O43189 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHF1O43189 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHF1O43189 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHF1O43189 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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