Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TO15178 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TO15178 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TO15178 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TO15178 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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