Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTPRTO14522 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTPRTO14522 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
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PTPRTO14522 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PTPRTO14522 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PTPRTO14522 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PTPRTO14522 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PTPRTO14522 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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