Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms