Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms