Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 446.4 ms