Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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