Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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