Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNMT3BQ9UBC3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNMT3BQ9UBC3 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms