Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms